[새소식] NGS 기반 pharmacogenotype 추출과 ancestry bias 보정 과제가 부각 - 2023년 7월
- 7월 4일 clinical next-generation sequencing 데이터에서 computational pharmacogenotype extraction 정확도를 검증한 연구 공개.
- 패널검사 없이 WGS·WES 데이터에서 주요 pharmacogene genotype을 재구성하는 방향이 실제 임상 데이터로 검증됐다는 점이 중요.
- 7월 13일 The Pharmaceutical Journal은 Bangor University postgraduate pharmacogenomics course 등록자가 사실상 약사 직역에 집중됐다고 보도.
- 7월 14일 ancestry and sex bias in pharmacogenomics 논문은 유럽계 편중 데이터셋 문제와 여성 과소대표 문제를 정면으로 지적.
- 기술 확장, 직역 교육, 데이터 편향 보정 과제가 동시에 제시되며 PGx 확산의 다음 병목이 더 구체적으로 드러남.
요약:
- NGS 재활용 가능성은 커졌지만, 교육과 데이터 대표성 문제가 동시에 해결돼야 한다는 점이 분명해짐.
출처
1. PubMed, Computational pharmacogenotype extraction from clinical next-generation sequencing, Epub 2023-07-04
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37469403/
2. The Pharmaceutical Journal, Only pharmacists have signed up to postgraduate pharmacogenomics course, 2023-07-13
https://pharmaceutical-journal.com/article/news/only-pharmacists-have-signed-up-to-postgraduate-pharmacogenomics-course
3. PubMed, Addressing Ancestry and Sex Bias in Pharmacogenomics, Epub 2023-07-14
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37450899/